成果發布網頁截圖。華大集團供圖
研究團隊以國產大豆品種“中黃13”為研究對象,開創性地構建了“宏觀-單細胞-空間”三級轉錄解析體系,通過多維技術融合,首次實現大豆器官的3D基因表達可視化,堪稱大豆界的“谷歌地圖”。
該研究完整呈現了大豆基因表達的時空動態信息,為理解大豆發育提供了前所未有的視角。
大豆器官發育的“時空圖譜”。華大集團供圖
其一,鑒定出大豆各器官特異性表達的基因,并以根瘤特異基因為例,證實GmPMTs基因通過基因串聯重復擴張,調控根瘤發育;
其二,構建器官發育全景圖譜,以葉片發育為例,首次發現展開期葉片的轉錄特異性,并對其中關鍵的長鏈脂肪酸共表達模塊進行了挖掘,為大豆葉片改良提供了新線索;
其三,構建了根尖空間3D轉錄圖譜,揭示大豆根尖細胞分化的動態路徑,為豆科根尖發育提供了發育藍圖;
其四,通過根瘤空間3D單細胞圖譜解析根瘤器官的細胞異質性,揭示了根瘤共生基因的空間定位,為“根系-微生物”互作研究建立了細胞級時空坐標系。同時發現維管束特異性GmHBs基因在根瘤早期發育中的決定性作用,為提升大豆共生固氮效率提供了新靶點。
文章共同第一作者、華大生命科學研究院助理研究員陳釧表示,相信這些成果將推動中國大豆科技向智慧育種新時代邁進。(完)
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